به گفته وی مدیریت جهاد که ایسنا را مزاحم فعالیت عادی خود می‌دانست این بار به شیوه‌ای دیگر سعی در ریزش بدنه ایسنا کرد و به شیوه‌های مختلف اصرار داشت که نزدیک به 40 نفر از سرمایه‌های اصلی این رسانه اخراج شوند که با ممانعت شدید بنده مواجه شد؛ در همین دایره بی‌مهری‌ها، در عمل جهاد دانشگاهی، ایسنا را از معادلات کلی خود حذف و هرگونه حمایت را از آن دریغ کرد تا جایی که در اوج گرفتاری‌ها و مشکلات مالی ایسنا حتی حاضر به پرداخت وام کوتاه مدت برای پرداخت حقوق پرسنل نشدند.

بعد از برکناری یکباره مدیرعامل خبرگزاری دانشجویان (ایسنا) از سوی مدیریت جهاد دانشگاهی، واکنش‌ها به این موضوع بالا گرفت و برخی رسانه‌ها در خبرهایی از پشت پرده این عزل و نصب‌ها در روزهای آخر دولت از سوی محمد حسین یادگاری خبر دادند.
این رسانه‌ها با اشاره به اینکه یادگاری رئیس جهاد دانشگاهی، در روزهای انتخابات از والی‌زاده مدیرعامل ایسنا خواسته تا از یک کاندیدای خاص حمایت کند نوشتند که یادگاری پس از انتخابات حاضر شد تا از یک رسانه دیگر بازدید کرده و از عملکرد آن در انتخابات تشکر کند اما راضی نشد تا از خبرگزاری زیرمجموعه خود بازدید و حتی
یک تشکر کند.
البته این اقدام‌های شتاب‌زده یادگاری به چندین ماه قبل و از زمانی که زمزمه‌های رفتن وی از جهاد دانشگاهی به گوش رسید سرعت بیشتری به خود گرفت. وی که در دوران مدیریت خود بیشتر معاونان جهاد دانشگاهی را از افرادی قرار داده است که مخالف دولت هستند بعد از جدی شدن احتمال برکناری به برخی افراد در مجلس نزدیک شد تا مانع برکناری خود شود.
اعتراضاتی که رئیس جهاد دانشگاهی واحد تهران (که به عنوان جهاد دانشگاهی مادر شناخته می‌شود) به ریاست جهاد دانشگاهی کل، در ماه‌های گذشته داشت نهایتاً به برکناری زهرا سادات محمدی از افراد نزدیک به دولت منجر شد.
حالا و در روزهایی که نه فقط دولت، بلکه یادگاری هم به پایان کار خود نزدیک می‌شود، این‌گونه عزل و نصب‌های شتاب‌زده و شاید خوش‌خدمتی برای ابقا در دولت آینده و زدوبندهای سیاسی با مخالفان دولت دهم نشان می‌دهد که خبری که چندماه گذشته در روزنامه ایران مبنی بر ضعف مدیریت در این مجموعه منتشر شد، صحت داشته است.
شاهد ضعف مدیریت جهاد دانشگاهی این اظهارنظر ساسان والی‌زاده مدیرعامل سابق ایسنا است که می‌گوید: در ناآشنایی مدیریت جهاد با رسانه همین بس که ایشان بارها از ارسال اخبار هنری و ورزشی گلایه و بیان می‌کرد که جهاد چه ارتباطی با ورزش، سینما و تئاتر دارد که اخبارش باید در رسانه جهاد منتشر شود و شگفت آنکه وی شورای رسانه‌ای متشکل از چند رسانه‌ای که وابستگی مستقیم به یک نهاد امنیتی داشتند تشکیل داد و آن را به عنوان شورای رسانه‌ای ایسنا معرفی کرد و در عمل در عوض آنکه از خبرنگاران صدیق و بی‌ادعای ایسنا و بنده در امور رسانه‌ای مشورت بگیرد دیدگاه‌های رسانه‌ای خود را با کسانی خارج از جهاد و ایسنا تنظیم می‌کرد.
وی در گفت‌وگو با ایران می‌افزاید: همین عینک بدبینی شدید به فعالیت ایسنا در عمل مانع ارتباط سازمانی ایسنا با جهاد شده و در کمال شگفتی مدیر کل امور اداری جهاد در نامه‌ای رسمی بیان کرد که ایسنا هیچ نسبت اداری و سازمانی با جهاد نداشته و آن را خارج از مجموعه جهاد اعلام کرد و حتی از جذب یکی از فرزندان شهدا که در ایسنا مشغول فعالیت خبری بود به همین علت امتناع کرد. جالب اینکه معمولاً در تعامل با سازمان‌هایی که برای مدیریت جهاد انتفاع داشت، از سرمایه خبری ایسنا هزینه کرده و به شیوه‌ای دیگر بداخلاقی‌های خود را ادامه می‌دادند.
والی‌زاده البته حاضر به بیان فشارهای بسیاری که در این سال‌ها از سوی مدیریت جهاد به او در زمینه حمایت ویژه از برخی سلایق سیاسی آن‌ها وارد می‌شده نیست و فقط به این بسنده می‌کند که «با آنکه آقای یادگاری مدیریت خود را برآمده از دولت دکتر احمدی‌نژاد می‌دانستند اما از آنجا که اعتقاد به انحراف و التقاط دولت داشتند عموما به همان نسبت سعی در ساقط کردن مدیریت بنده در ایسنا داشت، به گمان آنکه نکند ایسنا حمایت ویژه‌ای از دولت داشته باشد.
غافل از آنکه ایسنا در قالب شعار حمایت از دولت‌ها که از بدو راه‌اندازی آن شعار سازمانی این نهاد بوده، حمایت اصولی از دولت احمدی‌نژاد را وظیفه رسانه‌ای خود می‌دانست و البته هرگز جانب اعتدال و انصاف را فراموش نکرده و صدای گروه‌های سیاسی دیگر را در نهایت انصاف و سلامت منتشر می‌کرد.>
به گفته وی مدیریت جهاد که ایسنا را مزاحم فعالیت عادی خود می‌دانست این بار به شیوه‌ای دیگر سعی در ریزش بدنه ایسنا کرد و به شیوه‌های مختلف اصرار داشت که نزدیک به 40 نفر از سرمایه‌های اصلی این رسانه اخراج شوند که با ممانعت شدید بنده مواجه شد؛ در همین دایره بی‌مهری‌ها، در عمل جهاد دانشگاهی، ایسنا را از معادلات کلی خود حذف و هرگونه حمایت را از آن دریغ کرد تا جایی که در اوج گرفتاری‌ها و مشکلات مالی ایسنا حتی حاضر به پرداخت وام کوتاه مدت برای پرداخت حقوق پرسنل نشدند.
مدیرعامل سابق خبرگزاری ایسنا اذعان می‌کند: این بی‌مهری‌ها به ایسنا در شرایطی بود که بارها و بارها شاهد بازدید رسانه‌ای مدیر جهاد از رسانه‌های دیگر بودیم، در حالی که ایشان با حسرت در جلسات بیان می‌کرد که‌ای کاش ایسنا مانند خبرگزاری نهادهای خاص امنیتی فعالیت می‌کرد که این آرزوی دست‌نیافتنی او در دوره بنده محقق نشد.
والی‌زاده با بیان اینکه در دوره مدیریت خود تلاش کرده است تا ایسنا رسانه‌ای سالم، حرفه‌ای و معتدل بماند تصریح می‌کند: در طول 5/2 سال حضورم در ایسنا تعامل و همکاری شایسته‌ای میان من و بدنه ایسنا رخ داد که نمود آن در انتخابات مجلس و ریاست جمهوری ملموس بود و تلاش کردم در همه سطوح و وجوه از جمله ضریب نفوذ خبر، افزایش مخاطب، ایجاد سرویس‌های کاربردی جدید، ارتقای ادبیات خبر، پوشش حوزه‌های مغفول خبری و توجه به گرافیک در خبر، ایسنا را به مؤلفه‌های بالاتری ارتقا بدهم که نتایج این تغییرات در آمار معاونت مطبوعاتی ارشاد مبنی بر اینکه ضریب نفوذ خبر در ایسنا به 40درصد ارتقا یافته است نمود پیدا کرد.
به گفته والی‌زاده بهره او از حمایت‌های مدیریت کلان جهاد دانشگاهی این بود که پس از هر خبر عادی که برای مدیریت جهاد عجیب بود، کتبی یا شفاهی خواستار اخراج خبرنگار، دبیر و مدیر حوزه خبری می‌شد و نصیحت صادقانه بنده که شیوه اداره رسانه به این شکل ممکن نیست هم برای ایشان قابل هضم نبود و طبعاً اگر خوابی که وی برای ایسنا دیده بود از سوی بنده تعبیر شود نه تاک نشانی می‌ماند و نه از تاک نشان و به طور قطع ایسنا از سبد رسانه‌ای کشور حذف می‌شد.
وی می‌افزاید: همه تلاش بنده در ایسنا حفظ مخاطبان و عقلانیت در رویکردهای خبری، حمایت اصولی و معقول از دولت و انتشار نظرات منتقدان در دایره انصاف بود و هرگز ایسنا را در سبد هیچ حزب و جناحی خلاصه نکردم؛ چرا که آن را در تضاد با وظیفه یک رسانه سالم و فراگیر می‌دانستم و البته آنچه بر جهاد دانشگاهی گذشته است، حکایت مفصل دیگری است که باید از زبان جهادی‌ها شنید و بنده بنای ورود به آن را ندارم.